高性能计算集群助力纳米研究:成本效益与速度的完美结合
纳米技术领域正迅猛发展,现在,使用高性能计算集群开展纳米研究已成为一大潮流。这一方式与传统依赖大量实验的试错法大相径庭,后者需要成千上万次实验来排查,效率相当低下。那么,如何以较低成本实现快速筛选?这成为了众多纳米科研工作者关注的焦点。
高性能计算集群影响研究速度
纳米技术领域,高性能计算集群至关重要。选用不同的集群会显著改变研究进度。若科研人员选错了集群,计算过程将变得漫长,进而延误整个研究周期。在科研领域,时间即是成果,这种情况是不能接受的。因此,挑选合适的高性能计算集群对纳米研究至关重要。对于那些有时间限制的项目,计算速度的快慢直接关系到能否率先发布研究成果。
低预算下的配置考虑
众多纳米科研机构的经费有限,却迫切需要强大的计算资源。他们必须控制开支,避免超支,同时确保计算过程能够顺畅进行。传统的计算集群购置硬件成本高昂,且维护费用常常让预算紧张。此外,还需考虑计算速度、操作便捷性等多重因素。因此,寻求经济高效的计算解决方案,成为了每个纳米科研机构必须面对的难题。
北鲲云超算平台的软件优势
北鲲云超算平台软件功能强大,集成了VASP、NAMD、AMBER等300多种行业软件,可直接使用。这对科研人员来说极为便利。他们无需安装软件,节省了大量时间和精力。纳米研究涉及多种软件,此平台基本都能满足需求。这极大地提高了纳米研究的便捷性。
多作业提交方式便捷各类用户
北鲲云超算平台支持三种作业提交方式:命令行、工作站以及可视化界面。不论用户是否具备深厚的计算机专业知识,都能轻松掌握操作。对IT专家而言,命令行可能更符合高效工作的需求;而对于没有计算机专业基础的科研人员,可视化提交方式则更为直观易学。这一设计使得不同水平的科研人员均能借助该平台进行纳米研究计算。
高算力与大存储满足纳米研究需求
纳米材料的研究对计算能力和存储空间的要求相当高。在进行研究时,并行处理能力必须出色,否则可能会遇到运行不畅的问题。此外,纳米研究产生的数据量极其庞大,比如每天执行1000个基于密度泛函理论的材料计算任务,就能生成大约1TB的数据。北鲲云超算云平台的Cloud-HPC服务,提供了全球领先的A100和V100GPU卡,单个集群的算力最高可达100,000个核心,同时提供10PB的免费存储空间,这完全能够满足研究需求。
降低成本提高效率的实际案例
北京一所高校的课题组有这样一个经历,可以说明问题。他们需要对1074个氨基酸和众多水分子,总计78102个原子,进行长达5纳秒的分子动力学模拟。起初,他们打算利用公共云资源,但发现费用大大超出了预算。经过多番比较和选择,他们决定使用北鲲云的超算平台。结果,他们只花费了公共云资源的约20%成本,就完成了任务。这件事充分体现了北鲲云超算平台在降低成本和提升计算效率方面的优势。
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作者:小蓝
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